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在不孕症中，男性因素约占40%，女性因素约占40%，不明原因不孕症约占20%。女性不孕症的主要原因如下：
1.感染:大多数输卵管疾病继发于感染，尤其是盆腔炎症性疾病(pID)，其它原因包括阑尾穿孔、流产后感染等，粘连可导致输卵管闭塞。研究表明，在15~19岁的女性中，急性pID每1000人中约有10~13人，20~24岁时，每1000人增加到20人。性传播疾病(STIS)也会导致高发病率pID衣原体感染等发病率增加的重要原因。此外，阑尾穿孔是导致输卵管不孕的重要因素，感染性流产是输卵管不孕的另一个主要危险因素。
2.子宫内膜异位症：目前认为潜在的小或轻微的子宫内膜异位症（1或2）是否引起不孕症，可能是由于盆腔粘连和炎症因子导致生育能力低，3或4期子宫内膜异位症由于严重的盆腔粘连，会导致输卵管扭曲、排卵功能障碍和不孕。
3.手术后粘连：粘连会影响妊娠率。如果输卵管复通术后1年未怀孕或术中发现严重疾病，体外受精-胚胎移植(IVF-ET)可能是唯一的选择。
4.生殖道畸形:生育妇女子宫畸形发病率为1∶在不孕妇女中，594是1∶28。结果表明，不孕妇女先天性子宫畸形的发病率是正常妇女的21倍。子宫畸形中，7%为鞍状子宫，34%为纵隔子宫，39%为双角子宫，11%为双子宫，5%为单角子宫。鞍状子宫和双子宫对不孕症无明显影响，不完全子宫纵隔患者妊娠损失率明显增加，单角子宫不孕率明显增加。
5.己烯雌酚(DES)暴露：与子宫畸形密切相关，如短弯管和小开口皱缩伞端。结节性峡部输卵管炎表明峡部输卵管粘膜膨胀到肌层甚至浆膜下。虽然先天性和传染性憩室之间存在矛盾的证据，但它显然与不孕症和异位妊娠密切相关。其他畸形，如附属输卵管的开口和较长的输卵管纤毛综合征，也与不孕症密切相关。
6.Asherman’s综合征：最常见的是近期妊娠子宫扩张和刮伤、子宫肌瘤切除术等影响子宫内膜手术的异常，子宫内膜结核也可引起该疾病。通过宫腔镜检查，综合判断子宫粘连的分类，严重病例可能出现闭经症状。宫腔镜切除术是Asherman’s综合征的基本治疗方法。
7.子宫肌瘤:35岁以上女性子宫肌瘤的发病率为20%~25%。粘膜下肌瘤是不孕症的重要原因，粘膜下肌瘤切除术也是不孕症治疗的主要指征。对于肌壁间肌瘤对不孕症的影响，大多数研究认为直径小于4厘米的肌瘤对生育影响不大，分娩前切除增加妊娠子宫破裂的风险，但对于反复不孕症治疗失败和反复流产患者，可考虑妊娠前子宫肌瘤切除术。